A szigetországban még a toplistára sem fért fel a játék a megjelenés hetében.
A mai napon a hazai üzletek polcaira is felkerült Metroid Prime: Federation Force már egy hete elérhető Japánban, ahol - a frissen kiadott eladási számokat elnézve kijelenthetjük -, hogy nem aratott túl nagy sikert a kifejezetten többjátékos módra épülő Metroid spin-off. Az ázsiai szigetországban ugyanis mindössze 4286 darab talált gazdára a múlt héten csütörtökön debütált címből, ami arra sem volt elég, hogy a helyi toplistára felkerüljön az alkotás címe. Csak összehasonlításképp: a Metroid: Other M-ből több mint tízszer ennyi fogyott az első héten, míg a szintén spin-off kategóriába sorolt Animal Crossing mellékszál, a Happy Home Designer 522,556 darabban kelt el ugyanennyi idő alatt.
A Famitsu az adatok közlése mellet megjegyezte, hogy ez rendkívül meglepő teljesítmény egy Metroid játéktól, ugyanis a szériának komoly kultusza van a helyi játékosok körében. A Nintendo nem kommentálta a hírt, ha viszont a játék eladásai továbbra is ilyen alacsonyan maradnak - amelyre jókora esély van -, akkor nem kizárt, hogy hamarosan jóval kedvezőbb árcímke kerül majd a Federation Force dobozaira, hasonlóképpen, mint ahogyan az a vártnál gyengébben teljesítő Chibi-Robo: Zip Lash-el is történt.